Software livre dependendo de software proprietário

[Rafael Pezzi]

Pessoal,

Estou com uma dúvida:

Um pacote de simulação de física está disponível sob a licença GPL 2, 
mas as simulações dependem de java ou flash para ser executado: "Some of 
our simulations are Java Web Start based applications and others use 
Macromedia's Flash player." http://phet.colorado.edu/en/about/licensing 
e http://phet.colorado.edu/en/troubleshooting

Ja testei e não funcionam com o gnash. Este software pode realmente ser 
GPL se depende de software proprietário para ser executado? Alguém 
poderia esclarecer isto, por favor?

Att.
Rafael